两罪的行为结构相同，区别只在主体身份：挪用公款罪的主体是国家工作人员，或受国家机关、国企、事业单位、人民团体委托管理经营国有财产的人员；挪用资金罪的主体是上述之外的公司企业人员。

量刑差距显著：挪用公款最高可判无期徒刑（情节严重）；挪用资金最高七年。

身份认定的实务复杂性：国企中从事公务的人员按国家工作人员认定；受国企委派到参股混合所有制企业任职的，同样以国家工作人员论；纯粹的民企高管则适用挪用资金罪。村集体组织中，协助政府从事行政管理事务的村干部挪用时按挪用公款处理。

深圳国企混改企业中的涉案人员，罪名之差可达数年刑期，任命文件、委派手续、岗位职责的公务属性是辩护必查的底层文件，这直接决定适用哪套追诉标准与量刑档。